1. rozhoduje v pochybnostech, zda se jedná nebo nejedná o povrchové nebo podzemní vody

2. stanoví na návrh správce povodí rozsah záplavových území drobných vodních toků a ukládá mu zpracování takového návrhu

3. vydává souhlas k vypouštění ryb a ostatních živočichů nepůvodních, geneticky nevhodných a neprověřených populací přirozených druhů do vodních toků a vodních nádrží

4. vydává rozhodnutí o uložení povinnosti umožnit využití vodního díla nebo zařízení k povolenému nakládání s vodami jiné osobě

5. vydává povolení k těžbě písku, štěrku ,bahna apod. z pozemků na nichž leží koryto vodního toku

6. vydává opatření k nápravě stavu vody využívané ke koupání

7. vydává rozhodnutí o stanovení ochranných pásem vodních děl

8. vydává rozhodnutí o uložení povinnosti zpracovat a předložit ke schválení manipulační řád , jeho schválení

9. vydává rozhodnutí o uložení pokuty podnikající fyzické nebo právnické osobě za nedovolené vypouštění, odběry vod a za porušení povinnosti týkající se vodních děl založených stavebními předpisy

10. vydává povolení k nakládaní s podzemními vodami

- k odběru

      - k akumulaci

      - k čerpání za účelem snížení jejich hladiny

      - k umělému obohacování podzemních zdrojů povrchovou vodou

      - k jinému nakládání s nimi

11. vydává povolení k nakládaní s povrchovými vodami

- k odběru

      - k vzdouvání ,popř. k akumulaci

      - využívání jejich energetického potenciálu

      - k užívání těchto vod pro chov ryb, vodní drůbeže či jiných vodních živočichů za účelem podnikání

      - k jinému nakládání s nimi

12. vydává povolení k vypouštění odpadních vod do vod povrchových nebo podzemních

13. vydává rozhodnutí o prodloužení platnosti , změně ,zrušení povolení k nakládání s vodami

14. stanoví ochranné pásma vodních zdrojů,jejich změny nebo zrušení

15. vydává stavební povolení k vodním dílům

16. vydává souhlas ke stavbám a zařízením na pozemcích , na nichž se nacházejí koryta vodních toků nebo na pozemcích s takovými pozemky sousedících, pokud tyto stavby a zařízení ovlivňují vodní poměry

17. vydává souhlas ke stavbám ve vzdálenosti do 15 m od vzdušné paty ochranné hráze vodního toku

18. vydává souhlas ke stavbám v ochranných pásmech vodních zdrojů

Vydává rozhodnutí o uložení pokuty podnikající fyzické nebo právnické osobě za nedovolené vypouštění, odběry vod a za porušení povinnosti týkající se vodních děl založených stavebními předpisy.